Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01734 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01734 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01734 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01734 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01734 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01734 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
P01734 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01734 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01734 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01734 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01734 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01734 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01734 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01734 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01734 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01734 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01734 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01734 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01734 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01734 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01734 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01734 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01734 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01734 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01734 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01734 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01734 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01734 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01734 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01734 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01734 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
P01734 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01734 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01734 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01734 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01734 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01734 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01734 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01734 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01734 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
P01734 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01734 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01734 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01734 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
P01734 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01734 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01734 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01734 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01734 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01734 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01734 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01734 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01734 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01734 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01734 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01734 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01734 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01734 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01734 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01734 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01734 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01734 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01734 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01734 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01734 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01734 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01734 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
P01734 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01734 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01734 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01734 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01734 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01734 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
P01734 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01734 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01734 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01734 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01734 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01734 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01734 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
P01734 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01734 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
P01734 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01734 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01734 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01734 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01734 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01734 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01734 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01734 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01734 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01734 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
P01734 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01734 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01734 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01734 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01734 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01734 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01734 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms