Protein–RNA interactions for Protein: O88888

Apba3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba3O88888 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apba3O88888 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apba3O88888 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apba3O88888 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apba3O88888 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apba3O88888 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apba3O88888 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba3O88888 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apba3O88888 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apba3O88888 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apba3O88888 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms