Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema3fO88632 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema3fO88632 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema3fO88632 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms