Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tnnt1O88346 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tnnt1O88346 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt1O88346 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt1O88346 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
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