Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nid2O88322 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Nid2O88322 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nid2O88322 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Nid2O88322 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nid2O88322 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nid2O88322 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nid2O88322 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nid2O88322 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nid2O88322 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Nid2O88322 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nid2O88322 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nid2O88322 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nid2O88322 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nid2O88322 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nid2O88322 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nid2O88322 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nid2O88322 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nid2O88322 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms