Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ly86O88188 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly86O88188 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly86O88188 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly86O88188 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly86O88188 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly86O88188 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly86O88188 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly86O88188 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ly86O88188 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly86O88188 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly86O88188 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly86O88188 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly86O88188 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.4 ms