Protein–RNA interactions for Protein: O70343

Ppargc1a, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1aO70343 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1aO70343 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1aO70343 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1aO70343 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1aO70343 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppargc1aO70343 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1aO70343 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1aO70343 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1aO70343 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1aO70343 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppargc1aO70343 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppargc1aO70343 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppargc1aO70343 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppargc1aO70343 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppargc1aO70343 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms