Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb5O70309 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb5O70309 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Itgb5O70309 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms