Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna4O70174 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna4O70174 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna4O70174 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms