Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChkbO55229 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChkbO55229 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChkbO55229 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChkbO55229 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkbO55229 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChkbO55229 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChkbO55229 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkbO55229 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkbO55229 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkbO55229 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChkbO55229 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChkbO55229 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkbO55229 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms