Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp2a2O55143 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2a2O55143 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp2a2O55143 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2a2O55143 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms