Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole2O54956 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole2O54956 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole2O54956 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pole2O54956 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pole2O54956 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole2O54956 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole2O54956 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole2O54956 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pole2O54956 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pole2O54956 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pole2O54956 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole2O54956 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pole2O54956 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms