Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EomesO54839 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EomesO54839 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EomesO54839 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EomesO54839 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EomesO54839 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EomesO54839 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EomesO54839 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EomesO54839 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EomesO54839 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EomesO54839 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EomesO54839 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EomesO54839 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EomesO54839 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EomesO54839 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EomesO54839 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EomesO54839 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EomesO54839 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EomesO54839 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EomesO54839 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EomesO54839 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EomesO54839 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EomesO54839 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EomesO54839 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EomesO54839 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EomesO54839 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EomesO54839 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EomesO54839 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EomesO54839 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EomesO54839 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EomesO54839 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EomesO54839 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EomesO54839 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EomesO54839 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EomesO54839 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EomesO54839 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EomesO54839 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EomesO54839 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EomesO54839 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EomesO54839 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EomesO54839 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EomesO54839 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EomesO54839 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EomesO54839 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EomesO54839 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EomesO54839 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EomesO54839 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EomesO54839 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EomesO54839 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EomesO54839 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EomesO54839 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EomesO54839 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EomesO54839 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EomesO54839 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EomesO54839 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EomesO54839 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EomesO54839 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EomesO54839 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EomesO54839 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EomesO54839 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EomesO54839 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EomesO54839 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EomesO54839 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EomesO54839 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EomesO54839 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EomesO54839 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EomesO54839 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EomesO54839 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EomesO54839 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EomesO54839 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EomesO54839 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EomesO54839 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EomesO54839 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EomesO54839 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EomesO54839 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EomesO54839 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EomesO54839 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EomesO54839 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EomesO54839 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EomesO54839 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EomesO54839 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EomesO54839 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EomesO54839 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EomesO54839 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EomesO54839 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EomesO54839 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EomesO54839 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EomesO54839 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EomesO54839 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EomesO54839 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EomesO54839 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EomesO54839 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EomesO54839 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EomesO54839 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EomesO54839 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EomesO54839 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EomesO54839 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EomesO54839 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EomesO54839 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EomesO54839 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms