Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DffaO54786 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DffaO54786 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DffaO54786 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DffaO54786 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DffaO54786 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DffaO54786 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DffaO54786 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DffaO54786 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DffaO54786 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DffaO54786 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DffaO54786 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DffaO54786 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DffaO54786 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DffaO54786 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DffaO54786 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DffaO54786 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DffaO54786 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DffaO54786 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DffaO54786 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DffaO54786 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DffaO54786 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DffaO54786 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DffaO54786 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DffaO54786 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DffaO54786 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DffaO54786 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DffaO54786 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DffaO54786 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DffaO54786 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DffaO54786 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DffaO54786 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DffaO54786 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DffaO54786 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DffaO54786 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DffaO54786 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DffaO54786 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DffaO54786 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DffaO54786 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DffaO54786 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DffaO54786 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DffaO54786 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DffaO54786 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DffaO54786 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DffaO54786 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DffaO54786 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DffaO54786 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DffaO54786 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DffaO54786 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DffaO54786 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DffaO54786 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DffaO54786 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DffaO54786 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DffaO54786 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DffaO54786 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DffaO54786 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DffaO54786 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DffaO54786 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DffaO54786 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DffaO54786 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DffaO54786 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DffaO54786 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DffaO54786 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DffaO54786 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DffaO54786 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DffaO54786 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DffaO54786 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DffaO54786 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DffaO54786 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DffaO54786 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DffaO54786 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DffaO54786 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DffaO54786 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DffaO54786 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DffaO54786 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DffaO54786 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DffaO54786 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DffaO54786 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DffaO54786 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DffaO54786 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DffaO54786 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DffaO54786 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DffaO54786 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DffaO54786 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DffaO54786 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DffaO54786 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DffaO54786 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DffaO54786 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DffaO54786 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DffaO54786 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DffaO54786 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DffaO54786 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DffaO54786 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DffaO54786 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DffaO54786 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DffaO54786 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DffaO54786 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DffaO54786 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DffaO54786 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DffaO54786 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms