Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dsg3O35902 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsg3O35902 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms