Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn6O35454 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn6O35454 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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Clcn6O35454 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clcn6O35454 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn6O35454 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn6O35454 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn6O35454 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn6O35454 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn6O35454 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn6O35454 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn6O35454 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcn6O35454 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcn6O35454 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcn6O35454 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcn6O35454 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 820.8 ms