Protein–RNA interactions for Protein: O35231

Kifc3, Kinesin-like protein KIFC3, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc3O35231 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kifc3O35231 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kifc3O35231 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms