Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GclmO09172 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GclmO09172 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GclmO09172 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GclmO09172 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GclmO09172 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GclmO09172 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GclmO09172 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GclmO09172 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GclmO09172 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GclmO09172 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GclmO09172 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GclmO09172 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GclmO09172 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GclmO09172 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GclmO09172 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GclmO09172 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GclmO09172 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GclmO09172 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GclmO09172 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GclmO09172 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GclmO09172 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GclmO09172 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GclmO09172 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GclmO09172 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GclmO09172 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GclmO09172 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GclmO09172 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GclmO09172 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GclmO09172 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GclmO09172 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GclmO09172 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GclmO09172 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GclmO09172 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GclmO09172 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GclmO09172 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GclmO09172 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GclmO09172 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GclmO09172 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GclmO09172 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GclmO09172 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GclmO09172 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GclmO09172 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GclmO09172 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GclmO09172 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GclmO09172 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GclmO09172 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GclmO09172 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GclmO09172 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GclmO09172 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GclmO09172 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GclmO09172 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GclmO09172 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GclmO09172 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GclmO09172 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GclmO09172 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GclmO09172 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GclmO09172 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GclmO09172 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GclmO09172 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GclmO09172 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GclmO09172 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GclmO09172 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GclmO09172 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GclmO09172 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GclmO09172 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GclmO09172 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GclmO09172 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GclmO09172 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GclmO09172 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GclmO09172 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GclmO09172 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GclmO09172 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GclmO09172 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GclmO09172 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GclmO09172 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GclmO09172 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GclmO09172 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GclmO09172 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GclmO09172 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GclmO09172 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GclmO09172 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GclmO09172 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GclmO09172 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GclmO09172 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GclmO09172 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GclmO09172 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GclmO09172 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GclmO09172 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GclmO09172 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GclmO09172 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GclmO09172 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GclmO09172 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GclmO09172 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GclmO09172 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GclmO09172 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GclmO09172 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GclmO09172 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GclmO09172 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GclmO09172 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms