Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sypl1O09117 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sypl1O09117 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sypl1O09117 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sypl1O09117 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms