Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm8298J3QPI0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm8298J3QPI0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm8298J3QPI0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms