Protein–RNA interactions for Protein: G5E8S3

E230025N22Rik, Riken cDNA E230025N22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E230025N22RikG5E8S3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E230025N22RikG5E8S3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E230025N22RikG5E8S3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E230025N22RikG5E8S3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms