Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r67G5E8C1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r67G5E8C1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r67G5E8C1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r67G5E8C1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r67G5E8C1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r67G5E8C1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r67G5E8C1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r67G5E8C1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r67G5E8C1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r67G5E8C1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r67G5E8C1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r67G5E8C1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r67G5E8C1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r67G5E8C1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms