Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
XntrpcF8VQM8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XntrpcF8VQM8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XntrpcF8VQM8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms