Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmod3E9QA62 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lmod3E9QA62 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmod3E9QA62 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmod3E9QA62 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms