Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pate1E9Q658 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pate1E9Q658 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms