Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CenpfE9Q3P4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CenpfE9Q3P4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpfE9Q3P4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms