Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2cd2E9Q3C1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C2cd2E9Q3C1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2cd2E9Q3C1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2cd2E9Q3C1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2cd2E9Q3C1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2cd2E9Q3C1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2cd2E9Q3C1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2cd2E9Q3C1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C2cd2E9Q3C1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2cd2E9Q3C1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C2cd2E9Q3C1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2cd2E9Q3C1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2cd2E9Q3C1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2cd2E9Q3C1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C2cd2E9Q3C1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms