Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Wdr17E9Q271 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Wdr17E9Q271 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Wdr17E9Q271 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms