Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3250E9Q1M3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3250E9Q1M3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms