Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gcom1E9PZ54 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcom1E9PZ54 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcom1E9PZ54 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcom1E9PZ54 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms