Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srp54bE9PXC0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srp54bE9PXC0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms