Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn24D3YXJ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn24D3YXJ9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms