Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
9230113P08RikD3YWX3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
9230113P08RikD3YWX3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
9230113P08RikD3YWX3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms