Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nxpe3B9EKK6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nxpe3B9EKK6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nxpe3B9EKK6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms