Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf11cB4XVP9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf11cB4XVP9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Phf11cB4XVP9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf11cB4XVP9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf11cB4XVP9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf11cB4XVP9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms