Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zscan5bB2RTN3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zscan5bB2RTN3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan5bB2RTN3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms