Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc9bA3KGF9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc9bA3KGF9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc9bA3KGF9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms