Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb1A2AQ07 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb1A2AQ07 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb1A2AQ07 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms