Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ambra1A2AH22 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ambra1A2AH22 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ambra1A2AH22 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms