Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmem185aA2AF53 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem185aA2AF53 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem185aA2AF53 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms