Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Akap17bA2A3V1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Akap17bA2A3V1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Akap17bA2A3V1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms