Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm5538W4VSP6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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