Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vstm4T1NXB5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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