Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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