Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Clip2Q9Z0H8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip2Q9Z0H8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip2Q9Z0H8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip2Q9Z0H8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip2Q9Z0H8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip2Q9Z0H8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip2Q9Z0H8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip2Q9Z0H8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip2Q9Z0H8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip2Q9Z0H8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip2Q9Z0H8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clip2Q9Z0H8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Clip2Q9Z0H8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Clip2Q9Z0H8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Clip2Q9Z0H8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Clip2Q9Z0H8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Clip2Q9Z0H8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Clip2Q9Z0H8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Clip2Q9Z0H8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms