Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Psma1Q9R1P4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms