Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Plod3Q9R0E1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms