Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms