Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms