Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Tnnt3Q9QZ47 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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